O Governo Federal estabelece prioridades na aplicação dos recursos públicos e para a execução de seus programas estruturou o Plano Plurianual (PPA), relacionando os projetos de longo prazo com a lei Orçamentária Anual.

Com o objetivo de produzir edefinir conhecimento sobre Segurança e Saúde no Trabalho e Meio Ambiente, fomentar, entre os parceiros sociais, incorporação do tema na elaboração e gestão de políticas que visem ao desenvolvimento sustentável com crescimeto econômico, a promoção da eqüidade social e proteção do meio ambiente, a Fundacentro estruturou suas atividades em um conjunto de Programas e Subprogramas, que compõem o Plano Plurianual (PPA 2004 / 2007):

-- Coordenação de Documentação e Biblioteca

-- Divisão de Equipamento de Segurança

-- Divisão de Eventos

-- Atividades de Eventos

-- Programa Nacional de Segurança Química

-- Coordenação de Educação

-- Divisão de Publicação

-- Setor de Recursos Instrucionais

-- Gestão em SST

-- Programa Nacional de Eliminação de Silicose

-- Centro Colaborador da OMS

-- Programa de Engenharia da Segurança na Indústria da Construção

-- Análise do Trabalho

-- Coordenação de Seguraça no Processo de Trabalho

-- Proteção de Máquinas

-- Laboratório de Microscopia, Gravimetria e Difração de Raios X

-- Centro Estadual do Espírito Santo

-- Programa de Abrangência Diversificada

-- Divisão de Epidemiologia e Estatística

-- Diretoria Técnica

-- Pós-Graduação Sctritu Sensu em SST

-- Radiações Ionizantes

-- Programa Nacional de Prevenção da Exposição aos Agentes Ambientais

-- Prevenção e controle da exposição ocupacional a agentes ambientais

-- Coordenação de Higiene do Trabalho

-- Laboratório de Avaliação Clínica, Radiologica e Funcional em Doenças Pulmonares

-- Divisão de Gráfica

-- Centro Estadual do Pará

-- Prog. Nac. de Seg. Saúde e Meio Amb. de Trab. nas Atividades de pesca e mergulho profissional

-- Centro Estadual do Rio de Janeiro

-- Centro Estadual de Santa Catarina

-- PROGRAMA DE MELHORIA DAS INFORMAÇÕES ESTATÍSTICAS SOBRE DOENÇAS E ACIDENTES NO TRABALHO

-- Estudos e pesquisas sobre acidentes, doenças e mortes no ambiente de trabalho: identificação, mensur

-- Centro Estadual do Rio Grande do Sul

-- SUBPROGRAMA NACIONAL DE SEGURANÇA E SAÚDE DO TRABALHADOR NA ÁREA DE TRANSPORTE

-- Acidentes de trânsito

-- Escritório Representante da Baixada Santista

-- Escritório Representante de Campinas

-- Centro Estadual do Paraná

-- Segurança e Saúde no Trabalho Rural

-- Precarização do Trabalho

-- Revista Brasileira de Saúde Ocupacional

-- Avaliação dos Agentes Carcinogênicos/Mutagênicos no Ambiente de Trabalho

-- Programa Nacional em Segurança em Saúde do Trabalho para a Pequena Empresa

-- Centro Regional de Minas Gerais

-- Centro Regional da Bahia

-- Setor de Instrumentação

-- Coordenação de Saúde no Trabalho

-- PROGRAMA NACIONAL DOS TRABALHADORES PORTADORES DE DEFICIÊNCIA

-- Trabalhador Diferente

-- Centro Regional do Distrito Federal

-- PROJETOS ESPECIAIS

-- Laboratório de Inorgânica

-- Laboratório de Orgânica

-- Organização do trabalho e adoecimento

-- Centro Regional de Pernambuco

-- Escritório Representante de Mato Grosso do Sul

-- PROGRAMA NACIONAL DE EDUCAÇÃO EM SAÚDE DO TRABALHADOR